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図 2 4 年間の流れ()4 年間の流れ 2

2 年: 生命のしくみを学ぶ

分子生物学・生化学・細胞生物学・遺伝学・発生生物学・生態学・系統進化学の講義が出そろい、分子から生態系までの階層を一通り学ぶ 1 年です。実験では、無菌操作で大腸菌を育て、PCR や電気泳動で目に見えない DNA を扱い始めます。

実験室で、寒天の入った丸い皿に並ぶ白い点の集まりを数える学生、小さな管に液を入れる学生、パソコンで枝分かれした木の形の図を描く学生たち

ひとことで言うと

地図アプリのように、縮尺を切り替えて見る

スマートフォンの地図アプリは、日本全体から 1 軒の家まで縮尺を切り替えられます。2 年の生物学は、同じ生き物を分子・細胞・個体・生態系と、縮尺を切り替えて見る練習です。縮尺ごとに見えるものが違い、それをつなぐと生き物の全体が見えてきます。

01

2 年の科目: 分子から生態系まで、階層を一通り

2 年では、生物学の柱となる講義が出そろいます。千葉大学の生物学科では、2 年に発生生物学・細胞生物学・分子生物学・生理化学・生態学・系統進化学・生物数学などを学びます。実験も、分子遺伝学・発生生物学・生態学の実験と、系統学の野外実験に広がります。

東京理科大学の生命生物科学科でも、2 年に分子遺伝学・生化学・細胞生物学などが並びます(2025 年 4 月 1 日現在)。微生物学や、コンピュータで生命のデータを扱うバイオインフォマティクスもあります。半期の間、金曜日は朝から夕方まで遺伝子工学の基礎の実験です。

生物学では、生き物を、分子・細胞・組織と器官・個体・個体群と群集・生態系という入れ子の階層でとらえます。2 年の講義は、この階層を下から上まで一通り学ぶように組まれています。上の階層は下の寄せ集めではなく、部品どうしの関係から新しい性質が生まれる点に注目します。

別々に見える 2 年の科目は、階層のどこを扱うかでつながっています。

図解生物学の階層と 2 年の科目

  1. 生態系生態学: 生き物と環境のつながり
  2. 個体群・群集生態学・系統進化学: 種の集まりと関係
  3. 個体発生生物学: 1 個の受精卵から体へ
  4. 組織・器官生理学: 器官が働きを分担する
  5. 細胞細胞生物学: 生き物の基本の単位
  6. 分子分子生物学・生化学: DNA とタンパク質

02

遺伝暗号の解読: 試験管の中の「翻訳機」

分子生物学で必ず学ぶのが、DNA の情報がタンパク質に訳されるしくみです。核酸は 4 種類の文字(塩基)で、タンパク質は 20 種類のアミノ酸で書かれた文章にたとえられます。その 2 つの文字の対応表が、遺伝暗号です。

1968 年のノーベル生理学・医学賞の授賞式では、遺伝暗号の解読が、エジプトの象形文字の解読にたとえられました。象形文字は、同じ文を 2 種類の文字で刻んだロゼッタストーンを手がかりに読まれました。しかし、核酸とタンパク質を 1 文字ずつ見比べる方法は、技術的にできませんでした。

そこでアメリカのニーレンバーグは、試験管の中に、核酸の文をタンパク質の文に訳す「翻訳機」を組み立てました。1 種類の文字だけをつないだ核酸を入れると、できたタンパク質も 1 種類のアミノ酸だけでできていました。最初の 1 文字が読めた瞬間です。

最初の結果が報告されたのは 1961 年 8 月です。それから 5 年足らずで、暗号の全体が明らかになりました。解読に取り組んだホリー、コラナ、ニーレンバーグの 3 人が、1968 年の賞を受けています。

答えを知りたいとき、比べられる実験を設計するのが、分子生物学の面白さです。

図解最初の暗号を読んだ実験(1961 年)

  1. 1翻訳機をつくる試験管でタンパク質をつくる仕組み
  2. 21 文字の核酸同じ文字だけをつないだ核酸を入れる
  3. 3できた物を調べる1 種類のアミノ酸だけがつながった
  4. 4暗号の 1 つ目その文字の並びが、そのアミノ酸を指す

03

学生実験: 大腸菌を育て、DNA を増やす

2 年の実験では、目に見えない微生物や DNA を扱い始めます。東京理科大学の生命生物科学科の基礎遺伝子工学実験は、2 年の前期か後期(組によって異なる)の金曜日に、1〜5 限を通して行われます。最初に学ぶのは、消毒・滅菌と、ほかの菌を混ぜない無菌操作です。

続いて、大腸菌が増えていく様子をグラフにして、数が 2 倍になる時間(ダブリングタイム)を計算します。大腸菌に感染するウイルス(ファージ)を増やし、その DNA を取り出して制限酵素で切る実験もあります。

後半は PCR です。目当ての遺伝子を増やし、電気泳動で、予想どおりの長さの DNA ができたかを確かめます。2 回目の PCR は、実験の組み立てを各自で考えます。最後は、学術雑誌に投稿する形でレポートにまとめます。

持ち物には、白衣とともに方眼の実験ノートが指定され、前半の実験が終わると提出します。何をどれだけ入れたかを、その場で書き残す習慣が、ここで身につきます。

微生物の実験では、ほかの菌を入れない無菌操作がすべての基本です。

図解ダブリングタイムを計算する(例)

入力大腸菌の数を測ると、培養を始めたときは 1 mL あたり 200 万個、2 時間後には 1 億 2,800 万個だった
  1. 1増えた倍率 = 1 億 2,800 万 ÷ 200 万 = 64 倍
  2. 264 = 2 × 2 × 2 × 2 × 2 × 2 = 2⁶
  3. 32 倍になることが 6 回起きた
  4. 4120 分 ÷ 6 回 = 20 分
結果20 分ごとに 2 倍。このまま増え続けたら、12 時間で 2³⁶ 倍(約 690 億倍)になる計算
白い寒天の入った丸い皿に、水色の線で描いたクマと、赤紫の線で描いた草や貝、花の模様が浮かんでいる
色を出すように遺伝子を組み換えた何種類かの大腸菌で、寒天の上に描いた絵。線のように植えた菌が増えて集まり、模様になります。写真: LadaSy(CC BY 4.0・Wikimedia Commons)

04

2 年生の 1 週間(例): 実験の日と、系統樹を描く日

下の図は、2 年生の前期の 1 週間の例です。東京理科大学の大学案内に載っている 2 年生の前期の時間割を参考にしました。科目の名前や曜日は大学によって異なります。

東京理科大学のバイオインフォマティクス 1 では、データの並べ替えやグループ分けの考え方と、系統樹をつくるアルゴリズムを学びます。後半には Python の演習もあります。大学案内では、4 年生が、初めてのプログラミングで Python を使って系統樹を描いた体験を振り返っています。

野外に出る授業もあります。京都大学の主に 1・2 回生向けの生物学実習 II(自然史コース)では、花に来る昆虫を採集します。セミの抜け殻を集めて種類を見分け、統計の実習に使う回もあります。千葉大学の生物学科でも、2 年に系統学の野外実験があります。

図解2 年生の 1 週間(例)

  1. 月生化学・線形代数酵素の反応と行列の計算を学ぶ
  2. 火生命情報科学DNA の配列から系統樹を描く
  3. 水分子遺伝学・英語遺伝子がはたらくしくみを学ぶ
  4. 木生物有機化学生き物の分子を化学で読み解く
  5. 金遺伝子工学実験1〜5 限まで実験室で過ごす
  6. 土・日レポート・予習増え方のグラフを仕上げる
青い手袋をした手が、方眼の実験ノートに記録を書きこんでいる。横には小さな管を立てる黄色い台がある
実験ノートに記録をつける大学院生。何をどれだけ入れ、何が起きたかを、その場で書き残します。写真: Katherine Stember(CC BY 4.0・Wikimedia Commons)

05

つまずきやすい点と乗り越え方

2 年でつまずきやすいのは、覚えることの多さです。分子や酵素の名前が一度にたくさん出てきます。名前だけを覚えるより、「何から何をつくる反応か」という流れの図を自分で描くと、つながって覚えられます。

目に見えない DNA を扱う実験では、うまくいったかどうかを、電気泳動の帯などで間接的に確かめます。結果が出なかったときは、実験ノートの記録をたどり、どの段階に原因があるかを考えます。

千葉大学の生物学科では、2 年に生物学論文演習や、化学・生物の英語の授業があります。英語の教科書や論文を読む機会が増えるので、図から先に眺めて内容をつかむと読み進めやすくなります。

クイズ2 年の学びクイズ

このページで紹介した内容から出題します。

  1. Q1ニーレンバーグが 1 種類の文字だけの核酸を「翻訳機」に入れると、できたタンパク質はどうなった?

  2. Q2大腸菌が 2 時間で 64 倍に増えた。2 倍になるのに何分かかった?

  3. Q31968 年のノーベル賞の授賞式で、遺伝暗号の解読は何の解読にたとえられた?

0 / 3 問に回答

高校生のうちに試せること

  • 倍々に増える数を表計算ソフトで確かめる

    表計算ソフトの 1 行目に 1 と書き、次の行から「上の行 × 2」をくり返しましょう。20 分ごとに 2 倍になるとして、12 時間分(36 回)くり返した数を確かめます。実際の培養では、どこかで増えなくなります。その理由も考えてみてください。

  • 身近な生き物で系統樹を描く

    イヌ・ハト・カエル・メダカ・ヒトの 5 種類について、背骨・羽毛・肺・毛などの特徴を表にしましょう。共通する特徴が多いものどうしを近くに置いて、枝分かれの図を描きます。大学では、同じことを DNA の配列で行います。

  • セミの抜け殻を集めて種類を調べる

    夏に公園の木でセミの抜け殻を集め、図鑑などの見分け方を使って、種類ごとに数えましょう。京都大学の 1・2 回生向けの実習でも、セミの抜け殻の採集と種類の見分けを、統計の実習と組み合わせています。木の種類や高さで違いが出るかも記録してみてください。

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よくある質問

プログラミングの経験がなくても大丈夫ですか?

大丈夫です。東京理科大学のバイオインフォマティクス 1 では、データの扱い方やアルゴリズムの考え方を学んだあとで、Python の演習をします。大学案内でも、4 年生が、初めてのプログラミングで系統樹を描いたと話しています。

大腸菌を扱う実験は危なくないですか?

学生実験では、まず消毒・滅菌と、ほかの菌を混ぜない無菌操作を学んでから、大腸菌を扱います。白衣を着て、決められた手順と後片付けの方法を守ることが基本です。

2 年で野外に出ることはありますか?

大学によって異なります。千葉大学の生物学科では、2 年に生態学の実験や系統学の野外実験があります。京都大学の主に 1・2 回生向けの実習でも、京都の近くの山林や大学の緑地で、昆虫や植物、菌類などを調べます。